Медресе Аллакули-хана вместе с прилегающим караван-сараем Алла-Кули-хана входит в комплекс исторических и архитектурных достопримечательностей Ичан-Кала в городе Хива в Узбекистане являющегося музеем построек XIV века под открытым небом. Архитектура медресе Аллакули-хана считается одним из самых величественных и красивых строений того времени в городе. Двор медресе Аллакули-хана в Хиве немного отличается от традиционных дворов учебных заведений того времени. Ряды худжр, имеющих два этажа, опираются на края куполов тима и возвышаются над куполами входных ворот Палван-дарваза. Само здание медресе имеет форму не прямоугольника, а трапеции с четырехайванным двухэтажным двором.

В комплекс медресе Аллакули-хана входит 99 худжр (или келий), 2 мечети (зимняя и летняя в западном айване), аудитория для лекций (дарсхана), вестибюль при входе. Каждая худжра оснащена дверью и окном, нижняя ее часть отделана жжеными кирпичами в форме квадрата, а стены оштукатурены ганчем. Внутренние своды худжр ничем не украшены.

Архитектура позднего хорезмийского средневековья предстает здесь во всём великолепии. Значительные масштабы не вредят удивительной пропорциональности, а традиционный декор придаёт зданию одновременно строгость и небесную легкость. Арочные ниши и портал над входом, тимпаны и рамы двойной аркады, а также три четверти колонн портала тоже отделаны майоликой и изображениями в черных контурах, а также красивейшими растительными узорами. Южный портал строения обращается на себя внимание орнаментом в виде множества переплетающихся колец.